À l'intersection de l'Asie du Nord-Est et du Sud-Est se trouve une île mystérieuse et particulière, appelée Formose. Dans ce paysage merveilleux, montagnes, plaines et collines de toutes formes et tailles existent dans un environnement subtropical particulièrement propice à la culture des fruits. En fait, des fruits sont disponibles à la récolte à chaque saison sur cette île et, avec une culture appropriée, de délicieuses récoltes peuvent être produites tout au long de l'année.
Dans Harvest Island, les joueurs incarnent des cultivateurs, semant des graines dans différents types de champs sous des conditions météorologiques variées afin de maximiser leurs récoltes. En utilisant les connaissances acquises grâce aux prévisions météorologiques, les joueurs doivent récolter leurs cultures au bon moment afin de devenir le meilleur cultivateur que le pays ait jamais vu !