De retour à Bornéo, l'endroit où elle a grandi, Yoko Tsuno est confrontée à des événements étranges. Alors qu'elle visite des ruines de temple, deux hommes sortent de la jungle et suivent des empreintes au sol. Yoko se cache puis voit une étrange machine se matérialiser. Une jeune fille en sort. L'un des hommes tente de tuer cette fille, mais Yoko la sauve. La jeune fille explique à Yoko qu'elle vient du 39e siècle pour arrêter un certain Stephen Webbs qui a consacré sa vie à des recherches qui donneront au monde la « bombe à contraction », une bombe qui détruira la Terre et toute l'humanité...