Dans la métropole cyberpunk de Néo Saitama, Kenji Fujikido est un employé de bureau ordinaire dont la femme et les enfants sont soudainement assassinés. Remontant le meurtre jusqu'à un ninja, Fujikido s'entraîne pour se venger — d'abord de ceux qui ont assassiné sa famille, mais finalement de chaque ninja sur la planète. Il devient le « Ninja Slayer », un guerrier obsédé par le meurtre de tous les ninjas pour venger sa famille. Ninja Slayer a été initialement publié en segments sur Twitter ; il s'agit de la première collection complète de cette nouvelle série innovante.